Análisis metagenómico de la microbiota intestinal en pacientes con psoriasis de tipo 1

Autores/as

  • Ignacio Dei-Cas Médico Dermatólogo. Hospital Presidente Perón, Avellaneda. Buenos Aires, Argentina
  • Florencia Giliberto Doctora en Bioquímica. Laboratorio de Distrofinopatías, Facultad de Farmacia y Bioquímica-UBA, INIGEM, CONICET-UBA, Argentina
  • Alberto Penas Steinhardt Doctor en Biología. Laboratorio de Genómica Computacional, Dto. Ciencias Básicas-Universidad Nacional de Luján, Argentina

Resumen

Introducción: La psoriasis es una enfermedad inflamatoria crónica inmunomediada. La psoriasis tipo 1 (Ps1) o psoriasis de inicio temprano es la forma más frecuente de psoriasis y presenta una fuerte base genética. La microbiota intestinal está implicada en la maduración del sistema inmunitario y en múltiples vías metabólicas. Los trastornos en la composición bacteriana intestinal o disbiosis conllevan importantes consecuencias funcionales y han sido implicados en múltiples enfermedades.

El objetivo del estudio fue evaluar las diferencias en la microbiota intestinal de pacientes con Ps1 frente a sujetos de control no psoriásicos (SC).

Materiales y métodos: Se estudiaron 38 pacientes con Ps1 sin tratamiento y 27 SC. Se recolectaron muestras de materia fecal y se analizaron las regiones hipervariables V3-V4 del gen 16S rRNA, que fueron analizadas mediante la

plataforma de secuenciación Illumina MiSeq para determinar la composición y la diversidad microbianas. Se realizó un análisis bioinformático.

Resultados: No se encontraron diferencias en biodiversidad (diversidad alfa) entre los pacientes con Ps1 y los SC. El análisis de la diversidad beta mostró diferencias significativas entre ambos grupos (p =0,032). Al comparar los principales filos, solo el aumento relativo de Firmicutes en Ps1 mostró diferencias significativas (p < 0,05). El análisis LEfSe reveló mayor abundancia de los géneros Faecalibacterium y Blautia en pacientes con Ps1 y los géneros Bacteroides, Paraprevotella, Odoribacter, Anaerotruncus y Oscillospira en SC.

Conclusiones: Los resultados demuestran diferencias en la microbiota intestinal de los pacientes con Ps1 y en los SC, lo que implicaría que la microbiota intestinal ejerce una función por dilucidar en la patogenia de la psoriasis.

 

Palabras clave: psoriasis, microbiota intestinal, metagenómica.

 

Dermatol. Argent. 2019, 25 (4): 161-167

 

Metagenomic analysis of the gut microbiota in Type 1 psoriasis patients

 

Abstract

 

Introduction: Psoriasis is a chronic, immune-mediated inflammatory disease. Type 1 psoriasis (Ps1) or early onset psoriasis is the most common form of psoriasis and has a strong genetic component. The gut microbiota is involved in the maturation of the immune system and in multiple metabolic pathways. Disorders in the intestinal bacterial composition or dysbiosis carry important functional consequences and have been implicated in multiple diseases. The objectives of this study were to evaluate differences in the gut microbiota of patients with Ps1 vs. non-psoriatic control subjects (CS).

Materials and methods: We studied 38 patients with Ps1 without treatment and 27 CS. Stool samples were collected and the V3-V4 hypervariable regions of the 16S rRNA gene were analyzed using the Illumina MiSeq sequencing platform to determine microbial composition

and diversity. Bioinformatic analysis was performed.

Results: We did not find differences in biodiversity (alpha diversity) among patients with Ps1 and CS. Beta diversity showed significant differences between both groups (p = 0.032). When comparing the main phyla, only the relative increase of Firmicutes in Ps1 showed significant differences (p < 0.05). At genus level, the LEfSe analysis revealed greater abundance of Faecalibacterium and Blautia in patients with Ps1 and Bacteroides, Paraprevotella, Odoribacter, Anaerotruncus and Oscillospira in CS.

Conclusions: The results showed differences in the intestinal microbiota

of patients with Ps1 and CS, which would imply that the gut microbiota

plays a role in psoriasis pathogenesis.

 

Key words: psoriasis, gut microbiota, metagenomics.

 

Dermatol. Argent. 2019, 25 (4): 161-167

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Publicado

2020-09-08