Secuenciación masiva de ADN: la próxima generación

Resumen

El término secuenciación comprende el análisis de diferentes entidades moleculares a fin de conocer su composición nucleotídica precisa. Con ella es posible analizar un genoma completo (WGS, secuenciación genómica completa), un exoma (WES, secuenciación exómica completa), el transcriptoma (RNA-seq), paneles de genes y patrones genómicos de metilación. Los métodos de secuenciación masiva desarrollados después del método de Sanger, llamados de próxima generación, permiten secuenciar cantidades enormes de ADN e incluyen la pirosecuenciación, la secuenciación por unión y la secuenciación por síntesis. Su principal ventaja consiste en poder secuenciar gran cantidad de ADN en poco tiempo y a un costo relativamente bajo. Todas las técnicas de secuenciación masiva de próxima generación constan de cuatro pasos: preparación del templado (molde de ADN a
secuenciar), preparación de grupos de fragmentos de ADN clonal, secuenciación y análisis de datos. Mediante la secuenciación masiva se busca, por lo general, caracterizar variantes germinales y somáticas en pacientes individuales y, en cohortes con gran número de casos, identificar mutaciones tumorales drivers, mutaciones que predispongan al cáncer en la línea germinal o aquellas relacionadas con factores ambientales. Los grandes estudios poblacionales de asociación genómica (GWAS), de casos y controles, utilizan esta técnica.